Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP5Q96RT8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP5Q96RT8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms