Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UIMC1Q96RL1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UIMC1Q96RL1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms