Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD3

OR52E6, Olfactory receptor 52E6, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR52E6Q96RD3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OR52E6Q96RD3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OR52E6Q96RD3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms