Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACCSQ96QU6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACCSQ96QU6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms