Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF12Q96QT6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF12Q96QT6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms