Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q77

CIB3, Calcium and integrin-binding family member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB3Q96Q77 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIB3Q96Q77 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIB3Q96Q77 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms