Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALS2CR12Q96Q35 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALS2CR12Q96Q35 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms