Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF558Q96NG5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF558Q96NG5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF558Q96NG5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms