Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM20AQ96MK3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM20AQ96MK3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms