Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCZQ96LD1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCZQ96LD1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCZQ96LD1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCZQ96LD1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCZQ96LD1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCZQ96LD1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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