Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT74Q96LB3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1146.3 ms