Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00208Q96KT6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC00208Q96KT6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms