Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PRAC1Q96KF2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms