Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CHAMP1Q96JM3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CHAMP1Q96JM3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms