Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG1Q96JA1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG1Q96JA1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms