Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPD52L3Q96J77 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPD52L3Q96J77 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms