Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRMT2BQ96GJ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMT2BQ96GJ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms