Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAF2Q96CS3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAF2Q96CS3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms