Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ULK4Q96C45 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ULK4Q96C45 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms