Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC74AQ96AQ1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms