Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPTSSAQ969W0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPTSSAQ969W0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPTSSAQ969W0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPTSSAQ969W0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPTSSAQ969W0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPTSSAQ969W0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTSSAQ969W0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms