Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCE1Q969G3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCE1Q969G3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCE1Q969G3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms