Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LHX4Q969G2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LHX4Q969G2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms