Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAMP4Q969E2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP4Q969E2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms