Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TRIM41Q8WV44 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TRIM41Q8WV44 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TRIM41Q8WV44 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms