Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNIH3Q8TBE1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms