Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP35Q8NFH5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP35Q8NFH5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms