Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFSD9Q8NBP5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD9Q8NBP5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms