Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLRC2Q8NBF2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLRC2Q8NBF2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLRC2Q8NBF2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLRC2Q8NBF2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLRC2Q8NBF2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLRC2Q8NBF2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLRC2Q8NBF2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLRC2Q8NBF2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLRC2Q8NBF2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLRC2Q8NBF2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLRC2Q8NBF2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLRC2Q8NBF2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NHLRC2Q8NBF2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NHLRC2Q8NBF2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms