Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FSIP1Q8NA03 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FSIP1Q8NA03 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSIP1Q8NA03 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms