Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GJD3Q8N144 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJD3Q8N144 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms