Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMYD4Q8IYR2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD4Q8IYR2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms