Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FMNL3Q8IVF7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms