Protein–RNA interactions for Protein: Q86XQ3

CATSPER3, Cation channel sperm-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER3Q86XQ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CATSPER3Q86XQ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CATSPER3Q86XQ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CATSPER3Q86XQ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms