Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC6BQ86SZ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC6BQ86SZ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC6BQ86SZ2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC6BQ86SZ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC6BQ86SZ2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC6BQ86SZ2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC6BQ86SZ2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms