Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPCAT2Q7L5N7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT2Q7L5N7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms