Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNT7Q6ZNI0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNT7Q6ZNI0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNT7Q6ZNI0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms