Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP6Q6ZN66 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP6Q6ZN66 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms