Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMFQ6X4W1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms