Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCD3Q6STE5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMARCD3Q6STE5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms