Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL35Q6PF15 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL35Q6PF15 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL35Q6PF15 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms