Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF06

TRMT10B, tRNA methyltransferase 10 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT10BQ6PF06 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT10BQ6PF06 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT10BQ6PF06 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms