Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LGALS9CQ6DKI2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms