Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATL3Q6DD88 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.2 ms