Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A4Q6AI14 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms