Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INTS3Q68E01 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INTS3Q68E01 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms