Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALS2CLQ60I27 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALS2CLQ60I27 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms