Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECM29Q5VYK3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ECM29Q5VYK3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms