Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CHIC1Q5VXU3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
CHIC1Q5VXU3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms