Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP6Q5VW22 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP6Q5VW22 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms